Τα οφέλη για την υγεία των προβιοτικών δεν σχετίζονται μόνο με τα στελέχη που χρησιμοποιούνται αλλά επίσης συνδέονται στενά με τη δοσολογία. Η επιστημονική έρευνα δείχνει ότι τα προβιοτικά μπορούν να αποικίσουν, να πολλαπλασιαστούν και να ασκήσουν ρυθμιστικά αποτελέσματα στο έντερο μόνο όταν καταναλώνονται σε επαρκείς ποσότητες. Αυτό τους επιτρέπει να βελτιώσουν τη μικροχλωρίδα του εντέρου, να προάγουν την πέψη και την απορρόφηση θρεπτικών συστατικών ή να ενισχύσουν την ανοσία. Ωστόσο, η αποτελεσματική δόση ποικίλλει ανάλογα με το στέλεχος. Για παράδειγμα, ορισμένα στελέχη μπορεί να παράγουν θετικά αποτελέσματα σε ημερήσια πρόσληψη μόλις μερικών εκατοντάδων εκατομμυρίων ζωντανών κυττάρων, ενώ άλλα απαιτούν υψηλότερες ποσότητες για να επιτύχουν αξιοσημείωτα οφέλη.
Για το ίδιο στέλεχος, μέσα σε ένα συγκεκριμένο εύρος, μια υψηλότερη δόση είναι γενικά πιο πιθανό να παράγει σημαντικά οφέλη για την υγεία από μια χαμηλότερη δόση. Ωστόσο, αυτό δεν σημαίνει ότι «το περισσότερο είναι πάντα καλύτερο». Η υπέρβαση της συνιστώμενης δόσης δεν θα ενισχύει συνεχώς το αποτέλεσμα και μπορεί ακόμη και να οδηγήσει σε σπατάλη ή, σε ορισμένες περιπτώσεις, να αυξήσει τον κίνδυνο γαστρεντερικής δυσφορίας.
Επιπλέον, επειδή τα διαφορετικά στελέχη έχουν διακριτά χαρακτηριστικά και μηχανισμούς δράσης, η απλή σύγκριση του αριθμού των ζωντανών κυττάρων σε ένα προϊόν δεν υποδεικνύει τη συνολική του αποτελεσματικότητα. Ένας πιο επιστημονικός τρόπος αξιολόγησης της αποτελεσματικότητας των προβιοτικών είναι η αναφορά σε κλινικά στοιχεία που υποστηρίζουν το συγκεκριμένο στέλεχος και όχι απλώς στην ποσότητα. Όταν επιλέγουν προϊόντα, οι καταναλωτές θα πρέπει να εστιάζουν σε στελέχη με δεδομένα κλινικής έρευνας και έγκυρη πιστοποίηση, επιλέγοντας αυτά που ταιριάζουν στις ατομικές τους ανάγκες αντί να επιδιώκουν τυφλά υψηλές δόσεις ή τεράστιους αριθμούς ζωντανών βακτηρίων.